Canu软件同时适用于PacBio SMRT与纳米孔测序两款主流的单分子测序平台的数据,可以执行reads的纠错与组装部分的工作。Canu在做组装时,可获得更为准确的片段,其组装的准确性也是非常突出的[2]。

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Dot plots of the evaluated assemblies of P. falciparum[2]


注:组装结果的共线性评价,横坐标与纵坐标分别是参考基因组序列与各组装软件组装的基因组序列,共线性呈现对角线排布认为共线性较好

可以说Canu软件是非常受基因组学研究者所认可的一个工具,其组装质量好,Contig N50也具备竞争力,但也有一个致命缺陷:计算资源消耗太大,周期较长。相比于节点资源的Wtdbg2软件[3],Canu的资源消耗大约是数十倍甚至百倍的提升,而且随着基因组测序数据量的增加,会愈发明显。

Canu、

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